Каждая школа получит государственную поддержку из федерального бюджета в размере 1 млн. рублей на реализацию своей инновационной образовательной программы. По мнению Министра образования и науки Андрея Фурсенко, «господдержка инновационных школ позволяет существенно повысить не только их техническую оснащённость, но и качество предоставляемых образовательных услуг». Кроме того, заявил министр, конкурсные механизмы предоставления господдержки дают возможность оценить профессиональный уровень директоров российских школ в качестве менеджеров.

На данный момент 3 млрд. рублей субсидий уже направлены в субъекты РФ и в ближайшее время «школы-миллионеры» начнут реализацию инновационных образовательных программ.

Полученные средства школы смогут израсходовать на приобретение лабораторного оборудования, программного и методического обеспечения, модернизацию материально-технической учебной базы, повышение квалификации и переподготовку учителей. Победители конкурса также награждаются Дипломами министерства образования и науки Российской Федерации.